上一部结尾，尼奥（基奴李维斯 饰）终于意识到自己的能力和使命，中弹复活后，变成了无所不能的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回到了人类的基地锡安，受到人们的热烈欢迎。 此时，“母体”决定先下手为强，派出了两万五千只电子乌贼攻击锡安基地；墨菲斯、尼奥和崔妮蒂则再次进入“母体”，寻找“制钥者”，准备从内部破坏；而本该被尼奥消灭的特勤史密斯似乎出了点问题，脱离了“母体”的控制，拥有可怕的复制能力，阻碍尼奥他们的行动。
《冰冻人》是法国著名喜剧大师路易·德·菲奈斯主演，菲耐斯饰演青年的父亲和20世纪的假父亲. 1905年,一名25岁名叫保尔的年轻男子在北极失踪,1970年被人从一块冰中发现,竟然还活着,并被证实是一位名叫于贝尔妻子的爷爷。冰冻人保尔被于贝尔接回家,为了使他不至于对周围环境感到陌生,整个家甚至小镇全都恢复到20世纪初的样子。保尔醒来后思维和习惯还停留在那个年代,他把孙女当成自己的母亲,还向曾外孙的未婚妻示爱,由此引发一连串的笑话。
在克里斯（莱安·卡勒斯 Ryan Carnes 饰）7岁那年，他的母亲离开了家，父亲告诉克里斯，母亲被外星人绑架了，然而，这种话对于已经上小学的克里斯来说完全没有任何可信度。克里斯想要拍摄一部记录片来证明并没有外星人，以此戳穿父亲的谎言。为了收集资料，他参加了一个讨论组，并且就此结识了一个名叫艾米丽（乔丹·莘森 Jordan Hinson 饰）的女孩，据艾米丽所说，她每隔7年就会被外星人绑架一次。 一场意外的发生让克里斯开始动摇他坚定的信念，或许一切都没有他想象中的那么简单。母亲的失踪，父亲的言之凿凿，2小时空白的记忆，当克里斯越接近真相时，周围的一切就越让他感到困惑。
帕特里克昏昏欲睡在一家小型私立医院，他唯一的举动是非自愿地随地吐痰。当一个刚与丈夫分开的年轻护士开始在医院工作时，她感觉到帕特里克正在与她交流，他似乎正在利用自己的心理力量来操纵她生活中的事件。
