《飘移凶间》的故事讲述祖小艾和伍子茂、陆子寿三人在玫瑰山庄内，认识了性格孤僻的漫画小说家小梅，还有双腿瘫痪的毛志坚（黄秋生 饰）。毛志坚曾目睹亲子车祸死亡，从此双腿瘫痪。他有一位双目失明的太太，夫妻恩爱如昔。毛志坚结识了祖小丽，因为小丽和他从前的小儿子一样喜欢唐老鸭，但毛太太不喜欢祖小丽，结果引发出一段段恐怖的故事。
残唐乱世，瘟疫横行，传言妖女吴双化为邪祟祸害人间。然而，吴双的哥哥不良人吴令，从不相信自己善良的妹妹会是所谓妖女，他决心以缝尸还魂的秘术，复活被斩首的妹妹，在暗影涌动的瘟神庙中，设下诡局，审判真正的恶人，求一份清白与公道。 影片根据短篇小说《古庙夜谭》改编。
琪琪自幼便失去了父母，被送往了孤儿院。孤儿院中的生活状况十分堪忧，琪琪因此结识了很多和她一样游手好闲的小混混。误入歧途的琪琪从此走上一条不归路，并且最终犯下了杀人的重罪，在一场意外中，她和朋友们一起参与了分尸行动。自从那一天起，琪琪的生活变了样，每一天，她都生活在胆战心惊之中，没有睡过一个安稳觉。最终，受不了良心谴责的琪琪决定自首。 根据琪琪提供的线索，警方很快就将抛尸的地点锁定在了位于尖沙咀的一幢废弃的大楼里，最终，被分割的尸块重见天日，但随着警方的深入调查，更可怕的事情浮出了水面。
