侵华战争时期，日本人将掠得的北京猿人头骨偷运回国，途中沉没，成为一桩疑案。当年日本人将头骨化石偷运回国，隐藏几十年后，在和平环境下重新进行研究。他们将头骨化石中的DNA残片提取出来，进行培育，然后送入太空，据说这样便可以凭借太空中的粒子幅射，使其蕴育成熟。不料，载着北京猿人胚胎的飞船失事，坠入海岛，而北京猿人却成功地诞生了。 而王祖贤扮演的中国美丽女间谍的使命就是将北京猿人偷运回国，从此便和日本科学家展开了明争暗斗。最后，双方不分输赢，而是达成了共识：北京猿人不是任何一国的财富，他们属于大自然。于是，猿人一家三口和一只同样由基因技术复制出来的猛玛象被放归了自然。
滂沱雨夜里，朔也目击母亲坠入暴涨溪水中、失去踪影，自己也意外落桥，跌进长达一年的昏迷。一觉醒来，世界翻了面貌，警察判定母亲选择「自由死」，AI技术全面颠覆人类社会，有人因此解脱，有人无所适从。朔也无法接受母亲撒手人寰，为了抚慰内心伤痛，决意在虚拟世界里重建其模型，也让母亲的密友彩花自此走进他的生命。然而为了理解真相，秘密无所遁形，母亲从未揭露的一面也曝了光⋯⋯
未来世界，秘密系统“白金数据”得到开发，日本全国人民的DNA数据被存储其中，进而借此构建了一个检举率100%、冤案率0%的理想社会。可即便如此尖端的系统，也被代号为“NF13”的连环杀人案所难住，凶手犯案累累，且至今下落不明，甚至连“白金数据”的开发者蓼科兄妹也惨遭杀害。此后不久，特殊解析研究所的天才科学家神乐龙平（二宫和也 饰）对蓼科早树（水原希子 饰）尸体上提取的嫌疑人基因进行解析，竟发现真凶的矛头指向自己。凭借同事白鸟理沙（杏 饰）的帮助，神乐连忙逃脱，而以刑警浅间玲司（丰川悦司 饰）为代表的搜查一课早已在这座城市内部下天罗地网。在此过程中，神乐自身的秘密逐渐付出水面，真相更是出乎所有人意料…… 本片根据著名推理小说作家东野圭吾的同名原作改编。
因人体实验成为改造人类的キサラギ，正被一个组织追击。 这个组织是企图征服被分割的“东京”的不死吸血鬼团体“不死骑士团”。 发誓为死去的头目复仇的黑帮成员们也加入了追捕，形势升级为多方对抗。 “原本没有理由活下去，但也没有理由被这些家伙杀掉──” 运用改造过的身体中嵌入的各种武器和自己特殊的“血”，キサラギ地狱般的逃生大作战开始！！！
